《Kizuna no Allele》叙述如陨星般在网络世界中出场，知名度疯涨的超级偶像「绊爱」，连续五年得到「Virtual Grid Award」较大殊荣「金兔奖」后忽然大众的视野里消退。 随着时间的推移，美少女「Miracle」怀抱着对绊爱的向往而来到塑造虚似专业人才「Aden 学院」，和同伴们一起向着理想前行，渡过归属于他们的学院岁月。
马缔光也（樱井孝宏 配音）是一位性格非常内向的年轻人，总是无法很好的通过语言来传达自己的想法。可是这样的他偏偏进入了公司的第1营业部，每天的工作都让光也感到压力非常巨大。一天，光也意外的在大街上遇见了名为西冈正志（神谷浩史 配音）的男子，这个看似轻浮又油嘴滑舌的男人，竟然是辞典编辑部的一员。 正志在光也的身上发现了校编辞典的天赋，于是邀请他加入编辑部，开始了对于辞典《大渡海》的校编，光也就此结识了对文字爱得深沉的荒木公平（金尾哲夫 配音）、将自己的一生都投注到了辞海中去的松本朋佑（麦人 配音）以及性格非常努力务实的佐佐木薰（榊原良子 配音）。
在一个魔法消失后的时代，公主阿莱蒂（桑岛法子 配音）独自居住在高高的城堡塔楼里，等待来迎娶她的骑士。而国王为了从众多人选中选出驸马，提出只要谁能将魔法师的宝贝带回来，谁就可以取公主做新娘。时光荏苒，公主每天以书本来消磨时间。一晚，一位勇士偷偷溜进了公主的闺房，向公主示爱 ，可被公主回绝了。打发走了拜访者，一个小魔女从暗道里走了出来，告诉公主魔法失效的根源，自己也丧失了法力，再也无法变回原样。第二天清晨，一个拥有法力的魔法师（小山刚志 配音）乘坐着飞艇造访城堡，迎娶公主。魔法师用自己的魔法威逼国王交出公主。其实，昨晚公主在与小魔女的交谈中已经醒悟了，意识到不能再消极地等待下去了，应该主动追求自己想要的生活。收拾了行囊，趁夜色溜出了城堡……
打开通往异世界的大门后，天上优夜获得超强能力，脱胎换骨变成完美无缺的少年。在两个世界往返的他，「无自觉的外挂能力」愈来愈强大──!? 在异世界的洞窟里，他找到一本『贤者之书』，因此继承了传说贤者的超魔术。最强的体能再加上高强的魔术，他在异世界的进化简直没有极限... 现实世界当中，王星学园展开了校外教学！优夜活跃的表现陆续迷倒同年级的少女们，但是各方面都是顶尖水准的他不以为意，继续走自己的路！少年升级的脚步停不下来，全世界人类都将为他震惊──!!
