住在踯躅台的高中1年级生响裕太，某天醒来后失去了记忆。 之后，裕太与旧电脑里显现出来的“Hyper Agent·古立特”相遇了。 古立特告诉裕太“去完成使命”，而裕太则开始寻找这番话的意义以及自己的记忆。 虽然对这一突发事件感到困惑，裕太仍然在同班同学内海将以及宝多六花、新条茜等人的帮助下过着每一天。 然而，平稳的日常被突然现身的怪兽轻易地踏碎——。
马缔光也（樱井孝宏 配音）是一位性格非常内向的年轻人，总是无法很好的通过语言来传达自己的想法。可是这样的他偏偏进入了公司的第1营业部，每天的工作都让光也感到压力非常巨大。一天，光也意外的在大街上遇见了名为西冈正志（神谷浩史 配音）的男子，这个看似轻浮又油嘴滑舌的男人，竟然是辞典编辑部的一员。 正志在光也的身上发现了校编辞典的天赋，于是邀请他加入编辑部，开始了对于辞典《大渡海》的校编，光也就此结识了对文字爱得深沉的荒木公平（金尾哲夫 配音）、将自己的一生都投注到了辞海中去的松本朋佑（麦人 配音）以及性格非常努力务实的佐佐木薰（榊原良子 配音）。
在从便利商店回家的路上，突然被异世界召唤的少年菜月昴。在无法依靠任何东西的异世界，无力的少年手唯一的力量……那是“死去然后重新开始”的力量。为了守护最重要的人们，为了取回确实存在着又无可替代的时间，少年抗拒着绝望，勇敢地面对着残酷的命运。（本次新编集版在第一季动画基础上追加新场景，以2话合并成1话的形式制作成单集时长1小时的特别篇）
子之一族掀起的叛乱善后工作终于告一段落，猫猫也重新回到了花街，过起身为药师的日常生活。 某天，绿青馆端上的一顿早饭让猫猫察觉到了一丝“异样”，于是她开始追查这份违和感的真相。 另一方面，壬氏公开了自己真正的身份——皇弟，并开始直面与这一身份相伴的责任。 然而，楼兰最后托付给他的“国家即将遭受灾害的征兆”，却始终令他忧心不已。 与此同时，关于一名蛊惑人心的神秘仙女的传闻也开始四处流传，阴影再次笼罩茘国。 故事的舞台将从后宫扩展至市井，甚至延伸到邻国，而新的考验，也正在等待着猫猫与壬氏。
打开通往异世界的大门后，天上优夜获得超强能力，脱胎换骨变成完美无缺的少年。在两个世界往返的他，「无自觉的外挂能力」愈来愈强大──!? 在异世界的洞窟里，他找到一本『贤者之书』，因此继承了传说贤者的超魔术。最强的体能再加上高强的魔术，他在异世界的进化简直没有极限... 现实世界当中，王星学园展开了校外教学！优夜活跃的表现陆续迷倒同年级的少女们，但是各方面都是顶尖水准的他不以为意，继续走自己的路！少年升级的脚步停不下来，全世界人类都将为他震惊──!!
