自从超大型巨人出现，人类的和平与幻想被打破的那天开始，艾伦·耶格尔无尽战斗的日子就未曾中断……。毫无抵抗之力，眼睁睁看着母亲成为巨人的饵食，发誓将巨人一个不剩地从世上驱逐的艾伦。但，在残酷战斗的途中，他自己也变成了巨人的姿态——。为了夺回人类的自由而驱使巨人之力的艾伦，在席纳之墙的史托黑斯区与“女巨人”交锋。这场巨人之间的激烈战斗，由艾伦艰难地取得了胜利。即使如此，艾伦以及人类也没有休息的时间。下一场战斗已经宣告开幕。面对逼近罗塞之墙的大群巨人，人类将如何对敌！？
勇者艾莉西亚斩杀了多雷尔将军，海登与博雷托两国的战争就此落幕。 在包含艾斯琳在内的三国会谈中，众人争执的焦点，是多雷尔打造的 “秘密密室”。 围绕这间密室的下落，各国使者络绎不绝地前往博雷托的神学院鲁瑟因。 人群之中，也有已成为卢纳专属魔法导师的克伦的身影。
